D. Vavřík, J. Jakůbek, S. Pospíšil, J. Visschers, J. Zemánková, "Non-destructive Observation of Damage Processes in precracked specimens by X-Ray Dynamic Defectoscopy", Annals of the Marie Curie fellowships-Vol.3, pp. 69-75, ISBN 92 92 894 7233¬2 (2004)
J. Jakůbek, T. Holý, S. Pospíšil, J. Uher, D. Vavřík, Z. Vykydal, "High resolution neutron tomography with MEDIPIX-2", PSI Scientific Report 2004, Pages: 221-221, ISSN 1423-7326 (2005)
J. Jakůbek, "Neutron Imaging", Symposion in Memory of George Placzek (2005)
P. Lichard, M. Vojík, "Alternative parametrization of the pion form factor and the mass and width of rho(770)", arXiv:hep-ph/0611163 (2006)
K. Smolek, P. Beneš, S. Pospíšil, J. Smejkal, I. Štekl, "Detekce kosmického záření a střední školy v ČR", In: Veletrh nápadů učitelů fyziky 11. Sborník z konference; s. 113–117 (2006)
V. Linhart, I. Bědajánek, C. Lebel, C. Leroy, S. Pospíšil, I. Štekl, M. Vobecký, "Measurement of neutron induced activation of the SCT end-cap module", CERN internal report; 02 May 2006, ATL-INDET-PUB-2006-002
K. Smolek, P. Beneš, S. Pospíšil, I. Štekl, "Projekt detekce kosmického záření a střední školy v ČR", In: Veletrh nápadů učitelů fyziky 10. Sborník z konference; s. 162–165 (2006)
J. Smejkal, V. Jakubský, M. Znojil, "Relativistické vektorové bosony a PT-symetrie", arXiv.org/hep-th/0611287 (2006)
K. Smolek, "Studium kosmického záření", Pražská technika 05/2006, s. 28–30
A. Cieplý, J. Smejkal, "Kaonový vodík versus data pro systém K−p
při nízkých energiích", arXiv.org/0711.4928 [hep-ph] (2007)
A. Cieplý, J. Smejkal, "Mnohokanálový chirální přístup pro kaonový vodík", arXiv.org/0710.3602 [nucl-th] (2007)
L. Vála, "Results from the NEMO 3 experiment", arXiv:0710.5604 (2007)
K. Smolek, P. Beneš, M. Nyklíček, S. Pospíšil, P. Přídal, I. Štekl, P. Lichard, P. Kovačíková, "Současný stav zapojení středních škol do projektu CZELTA", In: Veletrh nápadů učitelů fyziky 12 (2007)
K. Smolek, "Studium kosmického záření v ÚTEF ČVUT", Československý časopis pro fyziku (2007)
J. Jakůbek, J. Dammer, T. Holý, M. Platkevič, J. Uher, Z. Vykydal, "Digitální transmisní radiografie s pixelovými detektory Medipix", Československý Časopis pro Fyziku, 1/2008, 25-36
D. Vénos, J. Jakůbek, O. Dragoun, S. Pospíšil, "Distribution of the 83Rb/83mKr activity on vacuum evaporated samples examined with the Timepix position sensitive detector", Report NPI ASCR ŘEŽ, EXP-01/2007 (2008)
J. Jakůbek, A. Cejnarová, M. Platkevič, M. Vobecký, "Integrace obrázků řízená externím spouštěcím signálem", Československý Časopis pro Fyziku, 1/2008, 46-49
D. Vavřík, T. Holý, J. Jakůbek, M. Jakůbek, J. Valach, "Mikroradiografické měření rozložení a koncentrace mědi v duralovém vzorku", Československý Časopis pro Fyziku, 1/2008, 58-61
J. Dammer, J. Jakůbek, D. Vavřík, "Mikroradiografie biologických vzorků", Československý Časopis pro Fyziku, 1/2008, 50-52
D. Vavřík, J. Jakůbek, M. Jakůbek, T. Holý, "Mikroradiografie v materiálovém výzkumu", Československý Časopis pro Fyziku, 1/2008, 53-57
C. Granja, J. Jakůbek, J. Uher, S. Pospíšil, T. Holý, V. Linhart, "Neutron physics studies at IEAP CTU", to be published (2008)
J. Jakůbek, A. Cejnarová, S. Pospíšil, J. Uher, "Polohově citlivá spektrometrie s pixelovými detektory Timepix", Československý Časopis pro Fyziku, 1/2008, 37-45
J. Jakůbek, "Zobrazování malých objektů v jiném světle
(Umění vidět neviditelné)", Vesmír 87, p 437 (2008)
J. Jakůbek, "Radiography: International Acclaim for Czech Scientists", Czech business and trade economic bi-monthly magazine, 03-04 2009, pages 14-15
L. Vála, "Results of NEMO 3 and status of SuperNEMO", arXiv:0901.0473 (2009)
C. Granja, M. Platkevič, "Detektor zmapuje kosmos", Pražská technika, 4/2012, p. 23
F. Krejčí, "Metoda objevující skrytou harmonii přírody: Prestižní ocenění v časopise Science pro vědce z ČVUT a UK", TechniCall 1 (2013)
A. Faessler, R. Hodák, S. Kovalenko, F. Šimkovic, "Search for the Cosmic Neutrino Background and KATRIN", arXiv:1304.5632 [nucl-th] (2013)