Vědeckou radu ústavu s platností od 16. 5. 2016 tvoří
- Prof. MUDr. Michal Anděl, CSc., 3. lékařská fakulta, Univerzita Karlova (ČR)
- Prof. Dr. Christer Fröjdh, Mid Sweden University (Švédsko)
- Doc. Dr. Ing. Vlajčeslav Georgiev, Fakulta elektrotechnická, Západočeská univerzita v Plzni (ČR)
- Ing. Jiří Hůlka, Státní ústav radiační ochrany, v.v.i., (ČR)
- Prof. Dr. Claude Leroy, Montreal University (Kanada)
- Doc. RNDr. Anna Macková, Ph.D., Ústav jaderné fyziky AV ČR, v.v.i. (ČR)
- Prof. Dr. Marzio Nessi, CERN (Švýcarsko)
- Dr. Alan Owens, European Space Agency (Nizozemsko)
- Prof. Ing. Stanislav Pospíšil, DrSc., ÚTEF, ČVUT v Praze (ČR)
- Dr. Pier Giorgio Rancoita, Istituto Nazionale di Fisica Nucleare (INFN) sez. Milano-Bicocca and Italian Space Agency (Itálie)
- Prof. Ruben Saakyan, University College London (UK)
- Doc. Ing. Ivan Štekl, CSc., ÚTEF, ČVUT v Praze (ČR)
Do 16. 5. 2016 působila vědecká rada ústavu ve složení
- Claude Leroy, Montreal University (Kanada)
- Sture Petersson, Mid Sweden University (Švédsko)
- Kenway M. Smith, University of Glasgow (UK)
- Jens Ludwig, Albert-Ludwigs University of Freiburg (Německo)
- Zdeněk Janout, ÚTEF, ČVUT v Praze (ČR)
- Rostislav Mach, Ústav jaderné fyziky AV ČR, v.v.i. (ČR)
- Vladimír Hnatowicz, Ústav jaderné fyziky AV ČR, v.v.i. (ČR)
- František Lehar, CEA Saclay (Francie), ÚTEF, ČVUT v Praze (ČR)